Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALB2P22676 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALB2P22676 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CALB2P22676 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CALB2P22676 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CALB2P22676 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CALB2P22676 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CALB2P22676 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CALB2P22676 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALB2P22676 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALB2P22676 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALB2P22676 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALB2P22676 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALB2P22676 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CALB2P22676 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALB2P22676 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALB2P22676 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALB2P22676 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALB2P22676 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALB2P22676 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALB2P22676 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALB2P22676 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALB2P22676 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms