Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MATN1P21941 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MATN1P21941 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms