Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CCDC179H3BU77 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms