Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC179H3BU77 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC179H3BU77 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC179H3BU77 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC179H3BU77 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC179H3BU77 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC179H3BU77 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC179H3BU77 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC179H3BU77 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC179H3BU77 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC179H3BU77 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC179H3BU77 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC179H3BU77 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC179H3BU77 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC179H3BU77 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC179H3BU77 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC179H3BU77 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC179H3BU77 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC179H3BU77 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC179H3BU77 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC179H3BU77 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC179H3BU77 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC179H3BU77 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC179H3BU77 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC179H3BU77 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC179H3BU77 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC179H3BU77 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC179H3BU77 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC179H3BU77 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC179H3BU77 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC179H3BU77 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC179H3BU77 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC179H3BU77 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC179H3BU77 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC179H3BU77 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC179H3BU77 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC179H3BU77 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC179H3BU77 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC179H3BU77 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC179H3BU77 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC179H3BU77 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC179H3BU77 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC179H3BU77 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC179H3BU77 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC179H3BU77 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC179H3BU77 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC179H3BU77 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC179H3BU77 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC179H3BU77 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC179H3BU77 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC179H3BU77 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC179H3BU77 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC179H3BU77 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC179H3BU77 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC179H3BU77 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC179H3BU77 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC179H3BU77 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC179H3BU77 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC179H3BU77 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC179H3BU77 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC179H3BU77 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC179H3BU77 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC179H3BU77 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC179H3BU77 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC179H3BU77 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC179H3BU77 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC179H3BU77 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC179H3BU77 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC179H3BU77 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC179H3BU77 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC179H3BU77 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC179H3BU77 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC179H3BU77 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC179H3BU77 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC179H3BU77 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC179H3BU77 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC179H3BU77 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC179H3BU77 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC179H3BU77 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC179H3BU77 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC179H3BU77 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC179H3BU77 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC179H3BU77 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC179H3BU77 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC179H3BU77 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC179H3BU77 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC179H3BU77 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC179H3BU77 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC179H3BU77 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC179H3BU77 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC179H3BU77 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC179H3BU77 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC179H3BU77 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC179H3BU77 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC179H3BU77 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC179H3BU77 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC179H3BU77 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC179H3BU77 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC179H3BU77 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC179H3BU77 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms