Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms