Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP11Q9Y3A2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms