Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPHS2Q9NP85 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms