Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms