Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms