Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZM9

PRR27, Proline-rich protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR27Q6MZM9 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PRR27Q6MZM9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms