Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRATP43155 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRATP43155 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CRATP43155 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CRATP43155 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CRATP43155 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms