Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTX3P26022 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTX3P26022 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTX3P26022 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTX3P26022 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTX3P26022 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTX3P26022 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTX3P26022 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTX3P26022 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTX3P26022 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTX3P26022 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTX3P26022 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTX3P26022 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTX3P26022 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTX3P26022 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTX3P26022 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTX3P26022 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTX3P26022 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTX3P26022 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTX3P26022 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTX3P26022 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTX3P26022 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTX3P26022 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms