Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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