Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms