Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms