Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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