Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STAMBPL1Q96FJ0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
STAMBPL1Q96FJ0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STAMBPL1Q96FJ0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STAMBPL1Q96FJ0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STAMBPL1Q96FJ0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STAMBPL1Q96FJ0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STAMBPL1Q96FJ0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STAMBPL1Q96FJ0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STAMBPL1Q96FJ0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms