Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms