Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms