Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SAMD13Q5VXD3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SAMD13Q5VXD3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SAMD13Q5VXD3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SAMD13Q5VXD3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SAMD13Q5VXD3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SAMD13Q5VXD3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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