Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms