Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CUL3Q13618 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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