Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELF3P78545 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ELF3P78545 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ELF3P78545 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELF3P78545 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELF3P78545 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ELF3P78545 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELF3P78545 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELF3P78545 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELF3P78545 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELF3P78545 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ELF3P78545 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELF3P78545 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELF3P78545 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ELF3P78545 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELF3P78545 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELF3P78545 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELF3P78545 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELF3P78545 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms