Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms