Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR7

BABAM2, BRISC and BRCA1-A complex member 2, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BABAM2Q9NXR7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BABAM2Q9NXR7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.5 ms