Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms