Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q499Y3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q499Y3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q499Y3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q499Y3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q499Y3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q499Y3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q499Y3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q499Y3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q499Y3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q499Y3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q499Y3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q499Y3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q499Y3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q499Y3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q499Y3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q499Y3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q499Y3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q499Y3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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