Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIS6

ZNF528, Zinc finger protein 528, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF528Q3MIS6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF528Q3MIS6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms