Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms