Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELF3P78545 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELF3P78545 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELF3P78545 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELF3P78545 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELF3P78545 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELF3P78545 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELF3P78545 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELF3P78545 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELF3P78545 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELF3P78545 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELF3P78545 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELF3P78545 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELF3P78545 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELF3P78545 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELF3P78545 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELF3P78545 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELF3P78545 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELF3P78545 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELF3P78545 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELF3P78545 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ELF3P78545 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELF3P78545 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms