Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms