Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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