Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms