Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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