Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms