Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR4P61073 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms