Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSG1P42857 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NSG1P42857 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NSG1P42857 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NSG1P42857 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSG1P42857 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms