Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA10O75578 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms