Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y9

SCN10A, Sodium channel protein type 10 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN10AQ9Y5Y9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN10AQ9Y5Y9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN10AQ9Y5Y9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN10AQ9Y5Y9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms