Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB5Q9Y5E4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB5Q9Y5E4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB5Q9Y5E4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB5Q9Y5E4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB5Q9Y5E4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB5Q9Y5E4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB5Q9Y5E4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB5Q9Y5E4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB5Q9Y5E4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB5Q9Y5E4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB5Q9Y5E4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms