Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y289

SLC5A6, Sodium-dependent multivitamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A6Q9Y289 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC5A6Q9Y289 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC5A6Q9Y289 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms