Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT6Q9ULM6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNOT6Q9ULM6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms