Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CHIC2Q9UKJ5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CHIC2Q9UKJ5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CHIC2Q9UKJ5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CHIC2Q9UKJ5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CHIC2Q9UKJ5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CHIC2Q9UKJ5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CHIC2Q9UKJ5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CHIC2Q9UKJ5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CHIC2Q9UKJ5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CHIC2Q9UKJ5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CHIC2Q9UKJ5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CHIC2Q9UKJ5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CHIC2Q9UKJ5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CHIC2Q9UKJ5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CHIC2Q9UKJ5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CHIC2Q9UKJ5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CHIC2Q9UKJ5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CHIC2Q9UKJ5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CHIC2Q9UKJ5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CHIC2Q9UKJ5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CHIC2Q9UKJ5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CHIC2Q9UKJ5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CHIC2Q9UKJ5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CHIC2Q9UKJ5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CHIC2Q9UKJ5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CHIC2Q9UKJ5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CHIC2Q9UKJ5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CHIC2Q9UKJ5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CHIC2Q9UKJ5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CHIC2Q9UKJ5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CHIC2Q9UKJ5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CHIC2Q9UKJ5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CHIC2Q9UKJ5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CHIC2Q9UKJ5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CHIC2Q9UKJ5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CHIC2Q9UKJ5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CHIC2Q9UKJ5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CHIC2Q9UKJ5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CHIC2Q9UKJ5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CHIC2Q9UKJ5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CHIC2Q9UKJ5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
CHIC2Q9UKJ5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CHIC2Q9UKJ5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CHIC2Q9UKJ5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CHIC2Q9UKJ5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CHIC2Q9UKJ5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CHIC2Q9UKJ5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CHIC2Q9UKJ5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CHIC2Q9UKJ5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CHIC2Q9UKJ5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CHIC2Q9UKJ5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CHIC2Q9UKJ5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CHIC2Q9UKJ5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CHIC2Q9UKJ5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CHIC2Q9UKJ5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms