Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT3LQ9UJW3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms