Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGY1

NOL12, Nucleolar protein 12, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL12Q9UGY1 DCAF8-205ENST00000419626 439 ntTSL 210.64□□□□□ -0.719e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 F5-201ENST00000367796 7039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.719e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 F5-202ENST00000367797 7024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.719e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.739e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 GGA3-222ENST00000621217 4181 ntTSL 210.47□□□□□ -0.739e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.759e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 MAD1L1-214ENST00000459731 371 ntTSL 310.32□□□□□ -0.769e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 NAV2-206ENST00000525322 2716 ntTSL 210.24□□□□□ -0.779e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 GGA3-223ENST00000621870 4034 ntTSL 1 (best)10.24□□□□□ -0.779e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.789e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 DCAF8-204ENST00000407642 517 ntTSL 210.12□□□□□ -0.799e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 DCAF8-216ENST00000495887 919 ntTSL 310.04□□□□□ -0.89e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 TGFBI-204ENST00000504411 1033 ntTSL 29.98□□□□□ -0.819e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 CLASP1-207ENST00000452274 3966 ntTSL 59.93□□□□□ -0.829e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 DCAF8-203ENST00000368074 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.839e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.849e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 GGA3-202ENST00000538886 3766 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.859e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 ARHGAP26-211ENST00000451259 527 ntTSL 59.62□□□□□ -0.879e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.879e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 AP1G2-219ENST00000555789 318 ntTSL 39.59□□□□□ -0.872e-7■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 AP1G2-230ENST00000557162 561 ntTSL 49.59□□□□□ -0.872e-7■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.889e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 CES2-205ENST00000563988 371 ntTSL 29.27□□□□□ -0.939e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 GGA3-210ENST00000580799 521 ntTSL 58.74□□□□□ -1.019e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 AL139011.2-202ENST00000485079 914 ntTSL 38.67□□□□□ -1.029e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.039e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 ARHGAP26-210ENST00000443674 2870 ntTSL 58.44□□□□□ -1.069e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 AP1G2-232ENST00000557391 459 ntTSL 28.44□□□□□ -1.069e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 ACSS2-224ENST00000497927 580 ntTSL 48.33□□□□□ -1.089e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.099e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.099e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 KMT2C-212ENST00000558084 16862 ntTSL 1 (best)8.24□□□□□ -1.099e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 ANKHD1-209ENST00000431508 4079 ntTSL 28.24□□□□□ -1.099e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 AP1G2-221ENST00000555974 349 ntTSL 38.22□□□□□ -1.092e-7■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 ACSS2-217ENST00000488172 648 ntTSL 48.18□□□□□ -1.19e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 COG4-210ENST00000564315 729 ntTSL 28.03□□□□□ -1.129e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 GGA3-207ENST00000578896 439 ntTSL 57.89□□□□□ -1.159e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 ANKHD1-211ENST00000433049 3649 ntTSL 57.67□□□□□ -1.189e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 ACSS2-204ENST00000464399 358 ntTSL 57.51□□□□□ -1.219e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 DCAF8-206ENST00000440682 501 ntTSL 37.11□□□□□ -1.279e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 CLASP1-209ENST00000463621 536 ntTSL 45.86□□□□□ -1.479e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 ACSS2-218ENST00000490046 455 ntTSL 44.67□□□□□ -1.669e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 ARHGAP26-216ENST00000470032 293 ntTSL 54.4□□□□□ -1.719e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 ACSS2-203ENST00000461051 403 ntTSL 32.96□□□□□ -1.949e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 TCIRG1-210ENST00000530063 220 ntTSL 1 (best)2.21□□□□□ -2.069e-6■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 ITIH3-205ENST00000465243 824 ntTSL 510.13□□□□□ -0.793e-7■■□□□ 14.3
NOL12Q9UGY1 AGRN-203ENST00000461111 3385 ntTSL 1 (best)15.04■□□□□ -04e-6■■□□□ 14.2
NOL12Q9UGY1 SLC16A3-218ENST00000583444 2882 nt22.39■■□□□ 1.176e-8■■□□□ 14.2
NOL12Q9UGY1 ATP13A1-214ENST00000497556 2442 ntTSL 216.44■□□□□ 0.224e-6■■□□□ 14.2
NOL12Q9UGY1 LRPAP1-204ENST00000515119 1167 ntTSL 213.36□□□□□ -0.278e-8■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 PFKL-205ENST00000466134 5986 ntTSL 222.89■■□□□ 1.264e-6■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 PFKL-207ENST00000474114 6007 ntTSL 1 (best)21.09■□□□□ 0.974e-6■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 PFKL-206ENST00000467315 1947 ntTSL 220.74■□□□□ 0.914e-6■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.834e-6■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 PFKL-211ENST00000498841 3122 ntTSL 1 (best)19.34■□□□□ 0.694e-6■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 PFKL-202ENST00000397961 3390 ntTSL 1 (best)17.44■□□□□ 0.384e-6■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 PFKL-204ENST00000460521 2818 ntTSL 216.57■□□□□ 0.244e-6■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 PHKA2-204ENST00000469645 728 ntTSL 515.69■□□□□ 0.12e-6■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 PHKA2-208ENST00000486231 317 ntTSL 59.19□□□□□ -0.942e-6■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 COL18A1-206ENST00000459895 588 ntTSL 312.54□□□□□ -0.42e-9■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.672e-10■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.542e-10■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.482e-10■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.262e-10■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.262e-10■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.262e-10■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.262e-10■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.262e-10■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.262e-10■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.262e-10■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.262e-10■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.262e-10■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 VEGFA-220ENST00000519767 970 ntTSL 1 (best)22.59■■□□□ 1.212e-10■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 RNA5SP141-201ENST00000364543 120 ntBASIC9.02□□□□□ -0.973e-23■■□□□ 14.1
NOL12Q9UGY1 PTPRF-207ENST00000436724 2168 ntTSL 1 (best)22.99■■□□□ 1.279e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.059e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 PLXNB2-202ENST00000411680 704 ntTSL 215.77■□□□□ 0.122e-6■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 COL9A3-211ENST00000477612 635 ntTSL 319.93■□□□□ 0.783e-11■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 RPL4-202ENST00000561554 580 ntTSL 48.82□□□□□ -11e-323■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 RPL4-213ENST00000566624 819 ntTSL 28.27□□□□□ -1.091e-323■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.43□□□□□ -1.381e-323■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 COL9A3-202ENST00000452372 596 ntTSL 519.04■□□□□ 0.643e-11■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.594e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.114e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.046e-17■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 CAPN15-203ENST00000565010 1952 ntTSL 1 (best)20.41■□□□□ 0.864e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.754e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.724e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.694e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.624e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 CABIN1-205ENST00000445422 1472 ntTSL 218.31■□□□□ 0.524e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 CABIN1-206ENST00000454754 1321 ntTSL 1 (best)18.05■□□□□ 0.484e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 COL9A2-204ENST00000427563 548 ntTSL 317.91■□□□□ 0.464e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 COL9A2-206ENST00000466267 835 ntTSL 517.68■□□□□ 0.424e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.394e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 COL9A2-207ENST00000482722 2887 ntTSL 1 (best)16.87■□□□□ 0.294e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.224e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.124e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.084e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 MCF2L-224ENST00000475524 604 ntTSL 415.12■□□□□ 0.014e-7■■□□□ 14
Retrieved 100 of 4,605 protein–RNA pairs in 286.2 ms