Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
MTRRQ9UBK8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MTRRQ9UBK8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 560.7 ms