Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.64■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
MBD5Q9P267 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
MBD5Q9P267 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
MBD5Q9P267 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
MBD5Q9P267 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
MBD5Q9P267 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
MBD5Q9P267 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
MBD5Q9P267 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
MBD5Q9P267 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
MBD5Q9P267 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
MBD5Q9P267 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
MBD5Q9P267 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
MBD5Q9P267 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
MBD5Q9P267 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
MBD5Q9P267 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
MBD5Q9P267 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
MBD5Q9P267 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
MBD5Q9P267 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
MBD5Q9P267 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
MBD5Q9P267 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
MBD5Q9P267 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
MBD5Q9P267 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
MBD5Q9P267 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
MBD5Q9P267 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
MBD5Q9P267 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
MBD5Q9P267 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
MBD5Q9P267 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.5■■■■□ 3.43
MBD5Q9P267 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
MBD5Q9P267 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms