Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI8

IGF2BP1, Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGF2BP1Q9NZI8 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.056e-7■■■■■ 29.3
IGF2BP1Q9NZI8 GAK-204ENST00000504435 4346 ntTSL 211.72□□□□□ -0.536e-7■■■■■ 29.3
IGF2BP1Q9NZI8 LAPTM4A-202ENST00000483117 487 ntTSL 25.27□□□□□ -1.572e-10■■■■■ 29.3
IGF2BP1Q9NZI8 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.882e-7■■■■■ 29.3
IGF2BP1Q9NZI8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.155e-11■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.185e-11■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 C2orf82-204ENST00000448993 357 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.12□□□□□ -0.313e-11■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.253e-10■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.262e-16■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 NUCB1-212ENST00000492367 1515 ntTSL 219.18■□□□□ 0.661e-8■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 CENPA-206ENST00000475662 1208 ntTSL 214.57□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.381e-8■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 SLC35F6-201ENST00000344420 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.591e-8■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 SLC35F6-203ENST00000429494 3738 ntTSL 1 (best)10.88□□□□□ -0.671e-8■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 SLC35F6-202ENST00000414029 3605 ntTSL 1 (best)10.07□□□□□ -0.81e-8■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 FANCI-211ENST00000566615 537 ntTSL 48.88□□□□□ -0.991e-8■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 KANSL1-216ENST00000577114 629 ntTSL 58.59□□□□□ -1.031e-8■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 FANCI-212ENST00000566895 4663 ntTSL 26.25□□□□□ -1.411e-8■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.61e-8■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.681e-8■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 FANCI-210ENST00000565522 233 ntTSL 54.09□□□□□ -1.751e-8■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 FANCI-203ENST00000447611 3690 ntTSL 23.42□□□□□ -1.861e-8■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.91e-8■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 FANCI-204ENST00000561894 3268 ntTSL 22.83□□□□□ -1.961e-8■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 RICTOR-207ENST00000511516 7312 ntTSL 1 (best)2.71□□□□□ -1.981e-8■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.991e-8■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.164e-8■■■■■ 29.2
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM131-202ENST00000409721 426 ntTSL 59.45□□□□□ -0.98e-7■■■■■ 29.1
IGF2BP1Q9NZI8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.284e-7■■■■■ 29.1
IGF2BP1Q9NZI8 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 29.1
IGF2BP1Q9NZI8 TMED5-203ENST00000370290 3847 ntTSL 1 (best)11.95□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 29.1
IGF2BP1Q9NZI8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.342e-21■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 CDK8-205ENST00000536792 3032 ntTSL 1 (best)16.69■□□□□ 0.262e-21■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 MAPRE3-209ENST00000494788 574 ntTSL 214.45□□□□□ -0.17e-8■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.052e-8■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.42e-8■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.182e-8■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 GYPC-205ENST00000464053 1805 ntTSL 1 (best)15.53■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 GYPC-204ENST00000459787 758 ntTSL 314.23□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.542e-8■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.083e-9■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.293e-9■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.293e-9■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 COPZ1-214ENST00000552218 797 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 SH3BGR-204ENST00000380637 1014 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.83e-9■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 COPZ1-212ENST00000551779 1462 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.871e-7■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.93e-9■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 VDAC1-205ENST00000466080 831 ntTSL 36.88□□□□□ -1.313e-9■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.331e-7■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 CALM1-204ENST00000553422 438 ntTSL 36.59□□□□□ -1.358e-18■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 PSME4-204ENST00000466539 548 ntTSL 46.47□□□□□ -1.373e-9■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 SH3BGR-207ENST00000447939 512 ntTSL 26.31□□□□□ -1.43e-9■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 SH3BGR-208ENST00000452550 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.31□□□□□ -1.43e-9■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 ASCC1-214ENST00000530394 839 ntTSL 54.23□□□□□ -1.733e-9■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.21e-8■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 COX7B-201ENST00000373335 497 ntTSL 24.54□□□□□ -1.681e-8■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 GDI2-206ENST00000456041 918 ntTSL 512.05□□□□□ -0.482e-9■■■■■ 29
IGF2BP1Q9NZI8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.129e-20■■■■■ 28.9
IGF2BP1Q9NZI8 TUBB-207ENST00000396384 2823 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.759e-20■■■■■ 28.9
IGF2BP1Q9NZI8 TUBB-208ENST00000396389 2903 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.89e-20■■■■■ 28.9
IGF2BP1Q9NZI8 TUBB-205ENST00000327892 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.819e-20■■■■■ 28.9
IGF2BP1Q9NZI8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.191e-9■■■■■ 28.9
IGF2BP1Q9NZI8 EIF2AK1-202ENST00000422786 782 ntTSL 310.79□□□□□ -0.682e-13■■■■■ 28.9
IGF2BP1Q9NZI8 FAT1-208ENST00000509647 1852 ntTSL 1 (best)15.82■□□□□ 0.123e-10■■■■■ 28.9
IGF2BP1Q9NZI8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.092e-8■■■■■ 28.8
IGF2BP1Q9NZI8 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.872e-8■■■■■ 28.8
IGF2BP1Q9NZI8 IL6ST-210ENST00000503773 3031 ntTSL 53.17□□□□□ -1.92e-8■■■■■ 28.8
IGF2BP1Q9NZI8 LRRC8D-204ENST00000441269 905 ntTSL 38.16□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 28.8
IGF2BP1Q9NZI8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.617e-9■■■■■ 28.8
IGF2BP1Q9NZI8 DNAJC8-205ENST00000489277 1600 ntTSL 1 (best)16.2■□□□□ 0.187e-9■■■■■ 28.8
IGF2BP1Q9NZI8 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.17e-9■■■■■ 28.8
IGF2BP1Q9NZI8 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.477e-9■■■■■ 28.8
IGF2BP1Q9NZI8 DNAJC8-206ENST00000603289 483 ntTSL 58.09□□□□□ -1.117e-9■■■■■ 28.8
IGF2BP1Q9NZI8 USP8-216ENST00000561206 556 ntTSL 26.12□□□□□ -1.437e-9■■■■■ 28.8
IGF2BP1Q9NZI8 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.557e-9■■■■■ 28.8
IGF2BP1Q9NZI8 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.587e-9■■■■■ 28.8
IGF2BP1Q9NZI8 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.627e-9■■■■■ 28.8
IGF2BP1Q9NZI8 SEC31A-210ENST00000503058 706 ntTSL 57.05□□□□□ -1.282e-6■■■■■ 28.8
IGF2BP1Q9NZI8 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.938e-7■■■■■ 28.8
IGF2BP1Q9NZI8 DLD-202ENST00000415325 1802 ntTSL 211.53□□□□□ -0.565e-7■■■■■ 28.8
IGF2BP1Q9NZI8 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.635e-7■■■■■ 28.8
IGF2BP1Q9NZI8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.975e-10■■■■■ 28.7
IGF2BP1Q9NZI8 ELK4-204ENST00000616704 2535 ntTSL 224.86■■□□□ 1.575e-10■■■■■ 28.7
IGF2BP1Q9NZI8 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.185e-10■■■■■ 28.7
IGF2BP1Q9NZI8 CR1L-204ENST00000530905 930 ntTSL 521■□□□□ 0.958e-9■■■■■ 28.7
IGF2BP1Q9NZI8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.674e-6■■■■■ 28.7
IGF2BP1Q9NZI8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 28.7
IGF2BP1Q9NZI8 CR1L-203ENST00000508064 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.658e-9■■■■■ 28.7
IGF2BP1Q9NZI8 CR1L-205ENST00000531844 663 ntTSL 28.47□□□□□ -1.058e-9■■■■■ 28.7
IGF2BP1Q9NZI8 HSDL1-208ENST00000619773 3059 nt8.39□□□□□ -1.074e-6■■■■■ 28.7
IGF2BP1Q9NZI8 CR1L-202ENST00000430248 351 ntTSL 34.69□□□□□ -1.668e-9■■■■■ 28.7
IGF2BP1Q9NZI8 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 28.7
IGF2BP1Q9NZI8 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 28.7
IGF2BP1Q9NZI8 MTHFD2-204ENST00000462026 599 ntTSL 511.55□□□□□ -0.562e-12■■■■■ 28.7
IGF2BP1Q9NZI8 ZMAT2-201ENST00000274712 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.925e-8■■■■■ 28.7
IGF2BP1Q9NZI8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.39e-7■■■■■ 28.7
Retrieved 100 of 17,531 protein–RNA pairs in 428.9 ms