Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCM9Q9NXL9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MCM9Q9NXL9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms