Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOR4AQ9NXH8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOR4AQ9NXH8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOR4AQ9NXH8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TOR4AQ9NXH8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOR4AQ9NXH8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOR4AQ9NXH8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOR4AQ9NXH8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOR4AQ9NXH8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOR4AQ9NXH8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOR4AQ9NXH8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOR4AQ9NXH8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOR4AQ9NXH8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOR4AQ9NXH8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOR4AQ9NXH8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOR4AQ9NXH8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOR4AQ9NXH8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOR4AQ9NXH8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOR4AQ9NXH8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOR4AQ9NXH8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOR4AQ9NXH8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms